CBA迎来了史上的第4个赛季，在98/99赛季时，CBA联赛效仿NBA在竞赛规则上进行了积极的改变，八一男篮依然无可匹敌成就四连冠的霸业。但军旅球队纷纷降级+解散，八一的未来已经变得严峻。两支升班马不再是鱼腩，北京奥神闯入四强，吉林队的孙军成为MVP+得分王。

八一四连冠延续王朝但未来隐忧已现！四川男篮3次严重违规被罚降级

这个赛季的赛制方面做出微调，半决赛开始便实行5场3胜制。同时为了增加比赛的观赏性和流畅度，竞赛规则上做出了巨大的改变。用四节制（每节12分钟）取代了上下半场，每次进攻时间由30秒缩减成25秒，过半场时间也从10秒缩减成7秒。初期因为很多球队不适应，屡屡出现进攻超时的情况。

八一男篮仍然是当之无愧的巨无霸，在常规赛豪取21胜1负的战绩，轻松斩获常规赛冠军。到了季后赛的舞台上，八一首轮以2-0淘汰浙江，半决赛以3-0横扫升班马奥神，总决赛也以3-0再次横扫老对手辽宁。八一实现4连冠的霸业，辽篮也成为3连亚。但随着空军队解散，济南军区队降级，接下来CBA的军旅仅剩下八一。眼前虽然仍没有对手能威胁到八一，但失去人才输送的宝库，八一未来的前景已经变得严峻起来。

但这个赛季最吸引眼球的并非八一，而是升班马奥神，他们拥有着马健、张涛和刘铁等名将，在还没正式登陆CBA赛场时，便夺得1998年亚俱杯的冠军。率领该队征战的是女帅李昕，她也成为CBA历史上首位女性主帅，但她没过多久便宣告下课，奥神又聘请洋帅麦基。值得一提的是，本赛季八一队的唯一一败，便是输给了奥神，作为升班马的奥神闯入四强，成为这个赛季的最大黑马。

四川男篮在该赛季3次出现严重违规，1999年3月3日，四川主场同山东之战，俱乐部在计时器上做手脚，导致比赛少打了3分钟；1999年3月7日，四川主场同吉林之战，俱乐部又在计分器上做手脚，将吉林队的3分球算作2分。在赛季结束后，四川男篮在人员转会操作上又出现违规，将内援张伟刚从临时转会私自变更为长期转会，并令报足球录像2名临时转会球员。最终四川男篮被勒令降级，这也轰动一时。